MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 62970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021081	ACG	2	6	249521	249526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5002	NC_021081	CTTT	2	8	249566	249573	0 %	75 %	0 %	25 %	482881894
5003	NC_021081	ACG	2	6	249604	249609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5004	NC_021081	GCA	2	6	249614	249619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5005	NC_021081	GCA	2	6	249632	249637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5006	NC_021081	CGG	2	6	249653	249658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881894
5007	NC_021081	TG	3	6	249732	249737	0 %	50 %	50 %	0 %	482881894
5008	NC_021081	GCT	2	6	249752	249757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5009	NC_021081	GCT	2	6	249830	249835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5010	NC_021081	CTAC	2	8	249929	249936	25 %	25 %	0 %	50 %	482881894
5011	NC_021081	TTG	2	6	249981	249986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881894
5012	NC_021081	TGGC	2	8	250107	250114	0 %	25 %	50 %	25 %	482881894
5013	NC_021081	CCA	2	6	250122	250127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881894
5014	NC_021081	TGG	2	6	250213	250218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881894
5015	NC_021081	GTT	2	6	250220	250225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881894
5016	NC_021081	ACC	2	6	250240	250245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881894
5017	NC_021081	T	6	6	250398	250403	0 %	100 %	0 %	0 %	482881894
5018	NC_021081	GCA	2	6	250446	250451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5019	NC_021081	AAG	2	6	250483	250488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881894
5020	NC_021081	TCG	2	6	250555	250560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5021	NC_021081	CCCTA	2	10	250567	250576	20 %	20 %	0 %	60 %	482881894
5022	NC_021081	GCG	2	6	250642	250647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881894
5023	NC_021081	GTTG	2	8	250778	250785	0 %	50 %	50 %	0 %	482881894
5024	NC_021081	AGG	2	6	250786	250791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881894
5025	NC_021081	GAC	2	6	250827	250832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5026	NC_021081	GGT	2	6	250904	250909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881894
5027	NC_021081	CTT	2	6	251041	251046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881894
5028	NC_021081	GGC	2	6	251122	251127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881894
5029	NC_021081	AT	3	6	251267	251272	50 %	50 %	0 %	0 %	482881894
5030	NC_021081	CA	3	6	251290	251295	50 %	0 %	0 %	50 %	482881894
5031	NC_021081	CCTC	2	8	251347	251354	0 %	25 %	0 %	75 %	482881894
5032	NC_021081	CCG	2	6	251359	251364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881894
5033	NC_021081	TAA	2	6	251408	251413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881894
5034	NC_021081	TGGC	2	8	251424	251431	0 %	25 %	50 %	25 %	482881894
5035	NC_021081	CCAAA	2	10	251505	251514	60 %	0 %	0 %	40 %	482881894
5036	NC_021081	GCC	2	6	251518	251523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881894
5037	NC_021081	TGC	2	6	251675	251680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5038	NC_021081	GGCC	2	8	251726	251733	0 %	0 %	50 %	50 %	482881894
5039	NC_021081	ACA	2	6	251746	251751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881894
5040	NC_021081	A	6	6	251761	251766	100 %	0 %	0 %	0 %	482881894
5041	NC_021081	CAG	2	6	251946	251951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
5042	NC_021081	GGCC	2	8	251979	251986	0 %	0 %	50 %	50 %	482881895
5043	NC_021081	CTG	2	6	252003	252008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881895
5044	NC_021081	CAG	2	6	252132	252137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
5045	NC_021081	GCC	2	6	252138	252143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881895
5046	NC_021081	GGC	2	6	252293	252298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881895
5047	NC_021081	CAC	2	6	252360	252365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881895
5048	NC_021081	AATCA	2	10	252408	252417	60 %	20 %	0 %	20 %	482881895
5049	NC_021081	ACC	2	6	252445	252450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881895
5050	NC_021081	AGC	2	6	252487	252492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
5051	NC_021081	GTG	2	6	252537	252542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881895
5052	NC_021081	CTG	2	6	252615	252620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881895
5053	NC_021081	GCA	2	6	252626	252631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
5054	NC_021081	GTG	2	6	252661	252666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881895
5055	NC_021081	TCA	2	6	252728	252733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881895
5056	NC_021081	GTG	2	6	252747	252752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881895
5057	NC_021081	GCCC	2	8	252759	252766	0 %	0 %	25 %	75 %	482881895
5058	NC_021081	GTA	2	6	252768	252773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881895
5059	NC_021081	GCA	2	6	252887	252892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
5060	NC_021081	GCA	2	6	252896	252901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
5061	NC_021081	GGC	2	6	252903	252908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881895
5062	NC_021081	GCA	2	6	252944	252949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
5063	NC_021081	CGG	2	6	252953	252958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881895
5064	NC_021081	GCG	2	6	252981	252986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881895
5065	NC_021081	GTC	3	9	252990	252998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881895
5066	NC_021081	CCA	2	6	253037	253042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881895
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5068	NC_021081	TCT	2	6	253085	253090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881895
5069	NC_021081	GTA	2	6	253128	253133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881895
5070	NC_021081	TGG	2	6	253166	253171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881895
5071	NC_021081	C	7	7	253227	253233	0 %	0 %	0 %	100 %	482881895
5072	NC_021081	CAA	2	6	253262	253267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881895
5073	NC_021081	GGTA	2	8	253379	253386	25 %	25 %	50 %	0 %	482881896
5074	NC_021081	CTG	2	6	253416	253421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881896
5075	NC_021081	TCG	2	6	253477	253482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881896
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5080	NC_021081	TCG	2	6	253852	253857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881897
5081	NC_021081	GGC	2	6	253899	253904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881897
5082	NC_021081	CAG	2	6	253938	253943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881897
5083	NC_021081	ACC	2	6	254005	254010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881897
5084	NC_021081	GGC	2	6	254013	254018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881897
5085	NC_021081	GGC	2	6	254049	254054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881897
5086	NC_021081	TGC	2	6	254101	254106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881897
5087	NC_021081	GGC	2	6	254109	254114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881897
5088	NC_021081	C	6	6	254185	254190	0 %	0 %	0 %	100 %	482881897
5089	NC_021081	GGA	2	6	254265	254270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881897
5090	NC_021081	GTG	2	6	254284	254289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881897
5091	NC_021081	CCG	2	6	254318	254323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881897
5092	NC_021081	GCCC	3	12	254395	254406	0 %	0 %	25 %	75 %	482881897
5093	NC_021081	A	6	6	254444	254449	100 %	0 %	0 %	0 %	482881897
5094	NC_021081	CAC	3	9	254561	254569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881898
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5099	NC_021081	GAG	2	6	255108	255113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881898
5100	NC_021081	CGT	2	6	255127	255132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881898
5101	NC_021081	CCA	2	6	255145	255150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881898
5102	NC_021081	GGGGT	2	10	255216	255225	0 %	20 %	80 %	0 %	482881898
5103	NC_021081	CCA	2	6	255247	255252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881898
5104	NC_021081	GTC	2	6	255263	255268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881898
5105	NC_021081	GCA	2	6	255274	255279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881898
5106	NC_021081	GTT	2	6	255428	255433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881898
5107	NC_021081	CGG	2	6	255463	255468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881898
5108	NC_021081	CTC	2	6	255494	255499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881898
5109	NC_021081	CAG	2	6	255524	255529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881898
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5111	NC_021081	GTT	2	6	255647	255652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881898
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5113	NC_021081	GC	3	6	255705	255710	0 %	0 %	50 %	50 %	482881898
5114	NC_021081	C	6	6	255744	255749	0 %	0 %	0 %	100 %	482881898
5115	NC_021081	ATC	2	6	255756	255761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881898
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5119	NC_021081	T	7	7	255984	255990	0 %	100 %	0 %	0 %	482881899
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5121	NC_021081	CTG	2	6	256087	256092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881899
5122	NC_021081	CTG	2	6	256132	256137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881899
5123	NC_021081	A	6	6	256280	256285	100 %	0 %	0 %	0 %	482881899
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5240	NC_021081	GGT	2	6	261441	261446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881902
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5242	NC_021081	GTA	2	6	261525	261530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881902
5243	NC_021081	GCTGG	2	10	261546	261555	0 %	20 %	60 %	20 %	482881902
5244	NC_021081	CA	3	6	261564	261569	50 %	0 %	0 %	50 %	482881902
5245	NC_021081	GTG	2	6	261573	261578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881902
5246	NC_021081	CGG	2	6	261581	261586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881902
5247	NC_021081	AT	3	6	261614	261619	50 %	50 %	0 %	0 %	482881902
5248	NC_021081	GTA	2	6	261639	261644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881902
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5250	NC_021081	CTG	2	6	261655	261660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881902
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5253	NC_021081	CCAG	2	8	261782	261789	25 %	0 %	25 %	50 %	482881902
5254	NC_021081	CTGCC	2	10	261792	261801	0 %	20 %	20 %	60 %	482881902
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5261	NC_021081	GGCCTC	2	12	262332	262343	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482881903
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5266	NC_021081	CTG	2	6	262561	262566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881903
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5277	NC_021081	GCA	3	9	263054	263062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881903
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5357	NC_021081	GTC	2	6	267315	267320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881907
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5361	NC_021081	C	6	6	267406	267411	0 %	0 %	0 %	100 %	482881907
5362	NC_021081	G	7	7	267494	267500	0 %	0 %	100 %	0 %	482881907
5363	NC_021081	CGC	2	6	267571	267576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881907
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5367	NC_021081	A	6	6	267786	267791	100 %	0 %	0 %	0 %	482881907
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5479	NC_021081	T	6	6	273432	273437	0 %	100 %	0 %	0 %	482881912
5480	NC_021081	TGG	2	6	273493	273498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881912
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5484	NC_021081	TTG	2	6	273711	273716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881912
5485	NC_021081	GCA	2	6	273752	273757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881912
5486	NC_021081	CGC	2	6	273765	273770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881912
5487	NC_021081	TTG	2	6	273843	273848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881912
5488	NC_021081	T	6	6	273854	273859	0 %	100 %	0 %	0 %	482881912
5489	NC_021081	TGC	3	9	273863	273871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881912
5490	NC_021081	ACC	2	6	273903	273908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881912
5491	NC_021081	TGG	2	6	273922	273927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881912
5492	NC_021081	T	8	8	273946	273953	0 %	100 %	0 %	0 %	482881912
5493	NC_021081	CCA	2	6	274012	274017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881912
5494	NC_021081	TTGT	2	8	274053	274060	0 %	75 %	25 %	0 %	482881912
5495	NC_021081	TACT	2	8	274140	274147	25 %	50 %	0 %	25 %	482881912
5496	NC_021081	CT	3	6	274149	274154	0 %	50 %	0 %	50 %	482881912
5497	NC_021081	GCA	2	6	274199	274204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881912
5498	NC_021081	CAG	2	6	274275	274280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881912
5499	NC_021081	T	7	7	274294	274300	0 %	100 %	0 %	0 %	482881912
5500	NC_021081	TGG	2	6	274321	274326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881912

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